組織固定、脫水、透明、浸蠟直至包埋，是制作優(yōu)質切片的關鍵過程。該過程也稱為組織處理。一旦組織處理有欠缺，往往導致無法挽回的后果。

固定后的組織不能直接用蠟滲透，首先要脫去組織中的水分。通常經過一系列的梯度乙醇脫水，如80%→95%→100%。第一步也可使用乙醇和福爾馬林混合液。也可以用其它脫水劑。丙酮脫水非?？?，但容易燃燒，為了安全，只有在手工處理組織時可少量使用。大多數脫水劑不能與石蠟直接相溶，所以脫水后必須再經過透明劑作用，才能對組織進行浸蠟。最后用石蠟包埋組織塊。

透明劑即可以與脫水劑相溶又能和石蠟相溶。透明劑是脫水和浸蠟的媒介劑，在組織處理中起著橋梁作用，當組織被透明劑浸透后，組織呈透明狀態(tài)。透明劑作用于組織的過程，稱為組織透明。最常用的透明劑是二甲苯。甲苯的作用非常好，組織中剩余少量水分也能使組織透明，但價格比二甲苯貴的多。使用氯仿透明對人的健康有危害。水楊酸甲脂也可以用于組織透明，但很少使用，主要是價格太貴。

組織經過二甲苯透明后，浸泡在熔化的石蠟中，組織浸蠟一般要通過2～3個蠟缸（蠟1、蠟2、蠟3），最終以石蠟替換出組織中的透明劑。石蠟的熔點一般為56～58℃，浸蠟的溫度通常比蠟的熔點高2℃左右。

上述組織處理過程一般由脫水機自動處理（也可手工操作）。組織在脫水機中從一個缸內移到另一個缸內，從一種試劑移到另一種試劑中，完全按照預先設置的時間和溫度程序自動完成。高檔的脫水機是由電腦控制，對試劑的密閉效果好，具有真空和加熱功能，使組織的處理更加完善。

組織處理的質量控制：

1.組織的處理時間，視組織的性質和組織塊的大小而有所不同。致密的組織、富含脂肪或纖維組織，處理所需的時間要比結構細膩、細胞成分多的組織長。最好能根據組織的性質和大小分類，分批進行處理，以便于掌握時間，保證質量。

2.較細小的組織，例如內窺鏡鉗取標本，穿刺標本，應與較大的組織塊分別進行處理。小組織濾紙包裹或者裝入專用的網狀脫水盒內，以免遺失。

3.組織處理所用的各種試劑，可根據工作量的大小，試劑消耗情況定時更換新液。一般情況下一月更換一次。

使用脫水機的參考程序：

程序一：下午下班前運行脫水機。第二天上午8時開始包埋。

時間 試劑

17:00 運行

1 17:45 出 10％中性福爾馬林溶液

2 18:30 出 10％中性福爾馬林溶液

3 20:00 出 80%乙醇

4 21:00 出 90%乙醇

5 23:00 出 95%乙醇

6 24:00 出 95%乙醇

7 1:30 出 100%乙醇

8 3:00 出 100%乙醇

9 3:30 出 二甲苯

10 4:00 出 二甲苯

11 5:30 出 石蠟（54℃）

12 8:00 出 石蠟（58℃）（蠟缸溫度62℃）

程序二：

時間 試劑

16：00運行

1 16:45 出 10％中性福爾馬林溶液

2 17:30 出 10％中性福爾馬林溶液

3 18:00 出 80%乙醇

4 19:30 出 90%乙醇

5 22:00 出 95%乙醇

6 22:30 出 95%乙醇

7 0:30 出 無水乙醇

8 2:30 出 無水乙醇

9 3:00 出 二甲苯

10 3:30 出 二甲苯

11 4:30 出 石蠟 (58℃)

12 5:30 出 石蠟(58℃)

13 7:30 出 石蠟 (58℃)

上述脫水、浸蠟及時間控制程序是經過長期的實際工作總結，并適合免疫組化的質量要求，一年四季的溫度、濕度變化等編制而成的。其中考慮到每種化學試劑的具體作用，特性和取材類型，在實際的工作應用中其效果，原則上滿意，可以保證常規(guī)切片的質量。如今后有工作人員需要對上述脫水、浸蠟時間程序改動，除了要考慮到上述因素之外，先提交申請，申明改動的理由及改進原理，經科主任批準后，可以開始批量試驗。在新程序不成熟以前，不準日常工作應用！待批量結果實驗以后，經全科工作人員對此進行評估，決定應用與否。如違背此規(guī)定，擅自改動者，為第一責任人，出現差錯者應受相應的處分。

工作中自動脫水機使用時的注意事項：

1.按脫水、透明、浸蠟順序設置試劑缸，缸的位置要準確，使標本掛籃升降轉換時準確落入下一級缸內。

2.保持各試劑缸內的試劑液面有足夠的高度，以使組織全部侵入液體內。

3.按設計好的組織處理時間表，調定時間控制裝置。

4.調定浸蠟缸溫度，一般要高出所用石蠟熔點溫度2℃左右。

5.將盛有組織塊的掛籃掛于升降架的掛鉤上，使之落入第一個脫水缸內，啟動機器后開始計時運轉。

6.當完成最后一道程序后，應及時取出標本進行包埋（必要時隨手關機）。